控除上限額は、自己負担が2000円で収まる寄付額の上限のことです。ふるさと納税で控除される金額には天井があり、その人の年収・家族構成・他に受けている控除(医療費控除や住宅ローン控除など)によって一人ひとり違います。上限の範囲内なら実質2000円で済みますが、その外に出た分には控除の恩恵がありません。
落とし穴は、上限を超えて寄付すると超過分がまるごと2000円に上乗せされる形で自己負担になる点です。各ポータルの「上限シミュレーション」はあくまで目安で、年の途中で収入や家族構成が変わると実際の上限とずれます。正確な上限は最終的なその年の所得が確定してから決まるため、ぎりぎりを狙うより少し余裕を持たせておくのが安全な型です。